Отец Сусуму пропал. Не в море, что было бы логично для конструктора подлодок, а прямо посреди испытательного заплыва, оставив после себя только недоделанную субмарину и кучу вопросов без ответов. Сусуму, молодой механик, привык возиться с железом, а не с семейными тайнами, но теперь ему приходится занять место в экипаже «Супер 99» и разбираться, куда делся батя.

Первое время кажется, что всё просто: есть враг по имени Океанская Империя, есть приказ, есть лодка, которая может тягаться с их флотом. Только вот Империя не зря захватила все моря. У них технологии, которых у японцев нет, и люди, которые знают о «девяносто девятой» больше, чем хотелось бы. А ещё внутри команды хватает своих скелетов. Сусуму чинит двигатель после каждого боя, но вот починить отношения с теми, кто рядом, куда сложнее.

Конфликт тут не только в торпедах. Это история про парня, который пытается быть механиком, а становится лидером, хотя никто его не просил. Про отца, который мог быть предателем или героем, и непонятно, что хуже. Про экипаж, где каждый второй что-то скрывает. Что найдёт Сусуму на дне океана, если доберётся до правды о Джузо, и останется ли у него после этого своя лодка?